Jika anda baru-baru ini telah bepergian ke luar negara, anda mungkin telah disambut ketika kembali oleh orang di beberapa terminal lapangan terbang di AS yang merekrut penumpang untuk diuji untuk virus COVID-19. Ini telah menjadi cara yang cukup produktif untuk mengikuti seberapa banyak COVID-19 yang mungkin memasuki negara, melalui penumpang, serta varian apa yang mereka bawa masuk.
Tepat pada masa musim perjalanan liburan sibuk, operator program ini, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC), Concentric oleh Ginkgo Bioworks (perusahaan bioteknologi berbasis di Boston), dan XpresCheck, yang merekrut dan menguji penumpang, sedang memperluas pemeriksaan untuk memasukkan virus selain SARS-CoV-2. Sejak Oktober, program ini telah memeriksa sebagian sampel dari penumpang untuk influenza dan RSV. Pada akhirnya, program ini akan memasukkan 30 patogen lain.
Sejak program ini diluncurkan pada tahun 2021, program Traveler-based Genomic Surveillance (TGS) telah memberikan jendela penting tentang bagaimana virus COVID-19 beredar, terutama karena lebih banyak orang mengandalkan tes di rumah yang tidak memerlukan mereka melaporkan hasil. Sekitar 6.000 penumpang yang tiba di tujuh bandara internasional utama AS diuji setiap minggu secara sukarela. Mereka juga memberikan informasi dasar, non-mengidentifikasi tentang asal penerbangan mereka, dan negara lain yang termasuk dalam jadwal mereka; dan menjawab pertanyaan tentang status vaksinasi, usia, dan apakah mereka telah berada dalam kontak dekat dengan siapa pun yang tes positif untuk COVID-19 baru-baru ini. Orang akan ditanyai pertanyaan serupa tentang flu dan RSV.
Hingga saat ini, program ini telah mendaftarkan lebih dari 360.000 penumpang dan mengurut lebih dari 14.000 sampel dan menambahkan data ini ke database genetik publik untuk membantu pejabat kesehatan masyarakat memahami lebih baik bagaimana dan di mana virus beredar. TGS mendeteksi kasus pertama dari varian BA.2.86 masuk ke AS di Agustus, dari seorang penumpang tiba di bandara Washington DC Dulles dari Jepang, bahkan sebelum negara itu mendeteksi kasus apa pun. Ini juga merupakan pertama kalinya varian itu ditemukan di luar Denmark dan Israel, di mana pertama kali dilaporkan.
“Kami telah cukup berhasil dengan platform ini,” kata Dr. Cindy Friedman, kepala Travelers’ Health Branch di CDC. “Penumpang dapat membantu kami mengisi kekurangan dalam pengawasan global karena mereka mendapatkan dan menyebarkan kuman saat bepergian. Mereka memberi kami pandangan awal tentang apa yang masuk ke negara, dan apa yang terjadi secara global.” Karena tidak semua negara memiliki program pengujian dan pengawasan penyakit menular yang kuat, TGS memberikan informasi berharga tidak hanya tentang apa yang terjadi di AS tetapi juga di seluruh dunia. “Kami tidak menunggu seseorang sakit dan kemudian pergi melihat penyedia layanan kesehatan atau pergi ke ruang gawat darurat,” kata Friedman. “Kami berusaha mendapatkan data satu langkah lebih awal.”
Friedman mengatakan dia dan timnya juga tidak sepenuhnya mengandalkan altruisme penumpang untuk menyerahkan swab hidung mereka saat turun dari penerbangan antarbenua panjang. Sejak diluncurkan pada tahun 2021, program ini juga mengumpulkan dan mempelajari sampel air limbah dari pesawat, dan air limbah dari saluran pembuangan bersama di mana pesawat membuang limbah mereka. Pengumpulan semacam itu dapat memberikan cara yang lebih efisien untuk melacak patogen yang masuk ke negara, kata Friedman, karena “satu sampel itu mewakili 200 hingga 300 orang di pesawat itu.” Friedman mengatakan timnya juga sedang menyelidiki pengambilan sampel udara dari bandara, yang dapat mendorong pengetahuan kami tentang penyebaran patogen global bahkan lebih jauh.
Dalam iterasi terbaru dari program ini, penumpang di empat bandara – John F. Kennedy di New York, San Francisco International, Logan di Boston, dan Dulles – sukarela mengambil swab hidung mereka dan Ginkgo menganalisis genetik tes positif apa pun untuk kehadiran SARS-CoV-2, influenza, dan RSV. Para ilmuwan baru-baru ini mulai memeriksa air limbah untuk virus tambahan ini juga. Jika urutan itu menunjukkan tanda-tanda mutasi atau perubahan lain, mereka dikirim ke laboratorium CDC di Atlanta untuk analisis lebih mendalam. Seperti tes COVID-19 asli, semua data genetik diunggah ke database genetik publik sehingga peneliti dapat mempelajarinya.
Dalam tahun-tahun mendatang, program ini akan menambahkan pengujian untuk puluhan virus dan bakteri lainnya, serta mutasi yang menunjukkan bahwa virus atau bakteri telah menjadi tahan terhadap perawatan yang ada. Pada akhirnya, Friedman mengatakan timnya berharap mengambil sampel udara dari bandara untuk memberikan data tambahan tentang patogen, dan untuk memperkuat kemampuan program untuk mengetahui di mana di dunia patogen berasal, dan apakah strain yang masuk ke negara itu membahayakan kesehatan masyarakat karena perawatan yang ada tidak akan dapat mengendalikannya.
Salah satu kelompok patogen semacam itu yang akan diperiksa termasuk parainfluenza, yang dapat berkontribusi pada croup atau pneumonia, dan dapat berbahaya bagi bayi muda. “Tidak ada genom publik untuk beberapa patogen pernapasan ini – tidak ada untuk parainfluenza 3, misalnya, dan tidak ada untuk human metapneumovirus – jadi kami akan mendapatkan urutan pertama yang dapat kami teliti lebih dekat,” kata Casandra Philipson, ahli biologi komputasi di Concentric. “Kami bersemangat tentang membangun basis data global awal untuk virus-virus ini. Semakin banyak kami buat publik, semakin banyak kami dapat berkontribusi untuk pemahaman umum yang lebih baik tentang patogen-patogen ini.”